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小基因組de novo測序

小基因組主要包括線粒體、葉綠體、病毒、質粒等,由於這些基因組大小通常小於1M,因此統稱為小基因組。基於高通量測序技術,對小基因組進行全基因組測序,可以得到其全基因組序列,並預測其重要的功能基因。基於全基因組序列,對於線粒體/葉綠體可以進一步研究物種分類、進化關係等;對於病毒、質粒可以則可以進一步研究致病性、與宿主的相互作用等。

應用領域
1、物種分類地方鑒定
2、物種進化分析

技術路線

分析內容
基因組組裝
基因組分預測
進化分析等

樣品要求
1) 樣品類型: DNA;
2) 樣品需求量:小基因組掃描圖:基因組DNA ≥2μg ;小基因組完成圖:基因組DNA ≥10μg;
3) 樣品濃度:≥30ng/µL;
4) 樣品純度:OD260/280=1.8-2.0並確保DNA無降解,無汙染;

項目周期
一般20-30個工作日,具體視基因組大小而定

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