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一、文章來源
基於RNA-Seq的通關藤藥用成分（多氧孕烷）合成基因發現及分子標記開發.鄭開顏，南京農業大學。
文章下載鏈接：http://www.gaswe.cn/uploads/tmp/genedenovo-resume-1413439299.6871349.pdf
樣品關係：單樣品，通關藤的莖與葉分別提取RNA後等量混合測序
二、研究思路
6個與多氧孕烷有關的基因qPCR結果
鯊烯合酶(SQS)
鯊烯環氧酶(SQLE)
C4-甲基固醇氧化酶(4-MSO)
3-β羥甾脫水酶(3-β-HSD)
孕酮-5β還原酶(5β-POR)
環阿屯醇合酶(CAS)
除5β-POR（多氧孕烷合成通路下遊的酶）在莖組織中上調外，其餘基因的均在葉組織中上調。說明多氧孕烷前體可能先在葉中合成，而後運輸到莖中進行後續修飾並儲存。因此在莖中積累了大量藥用成分
3-O-葡糖基轉移酶同源性分析
7個基因在物種間同源，證明了其產物的功能。（酰化和糖基化）
三、主要結果
1. 得到了通關藤的轉錄組參考序列，並找出了其中與藥用成分的合成相關的基因。
2. 使用qPCR的方法得到了目標基因的表達量，揭示了藥用成分的合成和運輸機製。
3. 對目標基因進行了家族樹分析，找出其在近緣物種間的同源性。