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報歲蘭轉錄組de novo及DGE

文章下載鏈接:http://www.gaswe.cn/uploads/tmp/genedenovo-resume-1386571250.4080574.pdf

中科院華南植物園項目

(一)轉錄組組裝質量評估

(二)特定(與開花相關)unigene

分析結果:根據轉錄組注釋結果,我們發現有120條unigene與花期相關;有73條MADS-box unigene;有28條CONSTANS-like unigene。

(三)DGE樣本差異表達分析

分析結果:

VP (vegetative phase):營養期報歲蘭

FDP (floral differentiation phase):花分化期報歲蘭

RP (reproductive phase):繁殖期報歲蘭

(四)與花發育有關基因分析及qRT-PCR驗證

結果分析:

營養期和花分化期樣本聚類關係較近,繁殖期樣本聚類關係較遠,這與三者基因表達差異情況是較為一致的

用於聚類的32個unigene與花的發育相關

qRT-PCR結果一致

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